Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 GLYAT-203ENST00000529732 1070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CUL1Q13616 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
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