Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PCDHA10-203ENST00000562220 12358 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RP1-206ENST00000636932 3649 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 NUMA1-201ENST00000351960 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CERS3-201ENST00000284382 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 C11orf44-201ENST00000317019 3547 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 HSPA8P16-201ENST00000454171 1865 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 TDRD3-202ENST00000377881 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL121910.1-201ENST00000420710 500 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 BX293535.1-201ENST00000443579 283 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 TDGF1P3-201ENST00000493351 567 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PSMA6-202ENST00000540871 912 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RNASE1-205ENST00000555698 655 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 FRG2GP-201ENST00000567870 615 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 HIGD1B-203ENST00000587021 457 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL118508.2-201ENST00000622708 673 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC007326.3-201ENST00000636418 176 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 TYW1-201ENST00000359626 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SLC16A1-AS1-204ENST00000428411 8757 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PAX6-273ENST00000640610 2730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 FIGNL1-211ENST00000611938 3543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC105383.1-202ENST00000505289 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 NEUROD6-201ENST00000297142 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 EIF1AD-201ENST00000312234 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 LINC01354-202ENST00000435574 2860 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC090197.1-202ENST00000519692 4374 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 LINC00838-201ENST00000562956 2936 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 NUDT21-201ENST00000300291 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC134508.1-201ENST00000570082 2977 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC110769.2-201ENST00000602760 1548 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ADGRF4-202ENST00000327753 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ADGRF4-203ENST00000371220 3075 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL353625.1-201ENST00000569097 3131 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 OTOA-202ENST00000388956 3466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ZNF347-207ENST00000601469 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SORBS2-206ENST00000393528 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PKD1L3-201ENST00000620267 5199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 OVGP1-201ENST00000369732 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PPP6R3-214ENST00000527403 4862 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SUN5-203ENST00000375523 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 COX17P1-201ENST00000378775 192 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SNRPGP11-201ENST00000411777 232 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AL592114.3-201ENST00000437919 446 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 ASS1P11-201ENST00000441309 1216 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 C3orf67-AS1-201ENST00000463703 562 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC130651.1-201ENST00000482912 598 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 PRPS1L1-201ENST00000506618 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 LEF1-AS1-205ENST00000508286 444 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 IGLV3-29-201ENST00000520084 244 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
MKRN4PQ13434 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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