Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 SP110-215ENST00000540870 2032 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 TP63-204ENST00000392460 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AMELY-202ENST00000383036 621 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL022724.1-201ENST00000412132 554 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ALG13-214ENST00000482742 620 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC114300.1-201ENST00000502347 280 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL020996.2-202ENST00000527604 334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LSM3P5-201ENST00000566307 306 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RN7SL381P-201ENST00000577658 298 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC015818.5-201ENST00000578659 356 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC073534.1-201ENST00000598671 1056 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.20-201ENST00000619896 275 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 STXBP5L-206ENST00000492541 3114 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 HS3ST5-202ENST00000411826 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 TYW5-201ENST00000354611 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 PPFIA2-220ENST00000550584 5405 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 NOS1-202ENST00000338101 4462 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 OR4D9-202ENST00000641278 6063 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 PREPL-208ENST00000410081 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC074281.1-201ENST00000436419 2081 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 BTN2A2-202ENST00000356709 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 DOCK11-202ENST00000276204 6664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 HAUS6-201ENST00000380496 3756 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SNORA57.2-201ENST00000391265 128 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINCMD1-201ENST00000418518 462 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RN7SL740P-201ENST00000467060 344 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 LINC01438-201ENST00000512794 556 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC107959.3-202ENST00000523806 450 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC022165.1-201ENST00000568771 596 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
MKRN3Q13064 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
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