Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DEFA6Q01524 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms