Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GPC5P78333 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
GPC5P78333 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
GPC5P78333 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GPC5P78333 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
GPC5P78333 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
GPC5P78333 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
GPC5P78333 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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GPC5P78333 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
GPC5P78333 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
GPC5P78333 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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