Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MAPK10-298ENST00000641297 3040 ntAPPRIS P2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL080317.3-201ENST00000607434 4315 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AP004243.1-202ENST00000398983 969 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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HOXD8P13378 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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HOXD8P13378 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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HOXD8P13378 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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HOXD8P13378 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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