Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SH3BP4Q9P0V3 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms