Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CIPCQ9C0C6 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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