Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RTL8BQ17RB0 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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