Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IMPG1Q17R60 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms