Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GPS1Q13098 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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