Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTPN13Q12923 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTPN13Q12923 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTPN13Q12923 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTPN13Q12923 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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