Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
E2F1Q01094 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
E2F1Q01094 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms