Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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CASQ1P31415 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CASQ1P31415 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CASQ1P31415 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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CASQ1P31415 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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CASQ1P31415 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CASQ1P31415 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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CASQ1P31415 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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CASQ1P31415 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CASQ1P31415 WBP1LP11-201ENST00000586141 328 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CASQ1P31415 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CASQ1P31415 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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