Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MXRA5-201ENST00000217939 9793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SH3GLB1-201ENST00000370558 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 KIAA0319-202ENST00000430948 6620 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AKAP12-202ENST00000354675 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SHPRH-206ENST00000438092 6994 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SNHG14-210ENST00000546682 8842 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 GFOD1-202ENST00000379284 8061 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZNF8-201ENST00000621650 9128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZAN-206ENST00000618565 8651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PKHD1P08F94 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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