Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 OR4F7P-201ENST00000402444 931 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 OR4F1P-201ENST00000405102 938 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 TTC21B-AS1-202ENST00000443032 544 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 MEF2AP1-201ENST00000454867 863 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RPL22L1-202ENST00000463836 506 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL161747.2-201ENST00000535893 472 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC078860.1-201ENST00000546601 527 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 MIR4664-201ENST00000583819 71 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL161725.1-210ENST00000590240 1224 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 STSP1-201ENST00000412493 1151 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC073367.1-201ENST00000421480 697 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 LINC01747-201ENST00000437696 1067 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC233290.1-201ENST00000553021 1186 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AF001548.1-201ENST00000577048 550 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC018521.6-201ENST00000584276 335 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms