Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SH3BP1Q9Y3L3 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1089.6 ms