Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL354732.1-204ENST00000421020 755 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP000552.2-201ENST00000422450 689 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RPSAP17-201ENST00000437336 883 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL136982.6-201ENST00000444180 1238 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL121748.2-201ENST00000451530 781 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RN7SL535P-201ENST00000479087 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 IGHV7-27-201ENST00000522512 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC104117.2-201ENST00000523735 515 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ELOCP22-201ENST00000529735 334 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC025419.1-209ENST00000544557 854 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RNASE12-201ENST00000556526 631 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC051619.8-201ENST00000563103 308 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 IGHV1OR16-4-201ENST00000566350 205 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ASIP-202ENST00000568305 610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC009831.3-201ENST00000582538 586 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC016629.3-202ENST00000596427 890 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC01515-207ENST00000598092 496 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RMRP-201ENST00000602361 268 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CT45A10-201ENST00000611668 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC105133.2-201ENST00000624158 461 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC005609.3-201ENST00000624566 577 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 DPH6-201ENST00000256538 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TEX9-201ENST00000352903 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC074198.1-201ENST00000506546 1397 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SMCO2-201ENST00000298876 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SPRR1B-201ENST00000307098 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP174-201ENST00000362702 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ERICH2-201ENST00000409885 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SMCO2-202ENST00000416383 1272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms