Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
USF2Q15853 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
USF2Q15853 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
USF2Q15853 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USF2Q15853 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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