Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SIX1Q15475 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SIX1Q15475 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SIX1Q15475 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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SIX1Q15475 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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