Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC025430.1-201ENST00000561324 498 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SMCO1Q147U7 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
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