Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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ITGA9Q13797 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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ITGA9Q13797 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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ITGA9Q13797 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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ITGA9Q13797 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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ITGA9Q13797 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ITGA9Q13797 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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