Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FHL3Q13643 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms