Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTP4A2Q12974 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTP4A2Q12974 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTP4A2Q12974 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTP4A2Q12974 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTP4A2Q12974 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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