Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TTPAP49638 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TTPAP49638 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TTPAP49638 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TTPAP49638 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TTPAP49638 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TTPAP49638 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TTPAP49638 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TTPAP49638 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms