Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms