Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CD34P28906 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CD34P28906 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CD34P28906 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms