Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC019080.4-201ENST00000606200 564 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC01204-203ENST00000609127 2900 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 SNORA68-201ENST00000384437 133 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
HOXA3O43365 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms