Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NEDD8-MDP1E9PL57 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms