Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SCN11AQ9UI33 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 ZNF555-201ENST00000334241 8557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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