Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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