Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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ZBED1O96006 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
ZBED1O96006 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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