Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL355480.4-201ENST00000626823 69 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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ARL2-SNX15V9GYD0 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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