Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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USP18Q9UMW8 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP18Q9UMW8 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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