Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CTNNA3Q9UI47 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.3 ms