Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ARNT2-207ENST00000533983 6690 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 ERCC4-201ENST00000311895 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
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LRRIQ1Q96JM4 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
LRRIQ1Q96JM4 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
LRRIQ1Q96JM4 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
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