Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
IMPG1Q17R60 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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