Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GIGYF2-204ENST00000409480 5976 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PDE6A-201ENST00000255266 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CACNA1C-202ENST00000335762 6968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ZDHHC21-201ENST00000380916 9160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 GREB1L-201ENST00000269218 5600 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RP1-201ENST00000220676 7100 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ARHGAP42P2-201ENST00000416089 2140 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ZNF423-203ENST00000561648 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 GSTO2-202ENST00000369707 6423 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MAPK8-201ENST00000360332 5438 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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