Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL390026.1-201ENST00000456647 457 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CDY2B-201ENST00000382867 1961 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CU633906.2-205ENST00000624847 1468 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 NRG3-206ENST00000545131 2713 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 FCAR-205ENST00000391723 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MIR1272-201ENST00000408106 129 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms