Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
BRD3Q15059 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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