Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
LRRTM2O43300 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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