Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CAVIN4Q5BKX8 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 OR10D3-201ENST00000318666 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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CAVIN4Q5BKX8 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CAVIN4Q5BKX8 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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