Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
RFTN1Q14699 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms