Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
CNGB1Q14028 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
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