Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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CUL1Q13616 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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CUL1Q13616 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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CUL1Q13616 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CUL1Q13616 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CUL1Q13616 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CUL1Q13616 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CUL1Q13616 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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