Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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TCIRG1Q13488 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TCIRG1Q13488 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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