Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SP140Q13342 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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SP140Q13342 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SP140Q13342 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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