Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 CCL2-202ENST00000580907 736 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AL162231.2-201ENST00000434627 665 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CXCL3P19876 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CXCL3P19876 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CXCL3P19876 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CXCL3P19876 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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CXCL3P19876 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CXCL3P19876 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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CXCL3P19876 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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CXCL3P19876 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 CLCN3P1-201ENST00000423965 1017 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CXCL3P19876 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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