Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP4Q9P0V3 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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