Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NRF1Q16656 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
NRF1Q16656 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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